Die Stiftung Gedenkstätte Lindenstraße pflegt ein lebendiges Netzwerk mit anderen Gedenkstätten, Museen, Vereinen, Kultur-, Bildungs- und Wissenschaftseinrichtungen.

Ein besonders enger Austausch verbindet die Stiftung Gedenkstätte Lindenstraße mit den beiden bürgerschaftlichen Initiativen, die die Arbeit der Gedenkstätte unterstützen und begleiten: die Fördergemeinschaft »Lindenstraße 54«  und die Häftlingsinitiative der Gedenkstätte Lindenstraße . Die Förderkreise leben vom Engagement ihrer Mitglieder und leisten durch ihre ehrenamtliche Arbeit einen wichtigen Beitrag zur erinnerungskulturellen Tätigkeit in der Gedenkstättenlandschaft der Region Berlin-Brandenburg.

Die Stiftung Gedenkstätte Lindenstraße wird gefördert von der Landeshauptstadt Potsdam und vom Ministerium für Wissenschaft, Forschung und Kultur des Landes Brandenburg.