Die Stiftung Gedenkstätte Lindenstraße pflegt ein lebendiges Netzwerk mit anderen Gedenkstätten, Museen, Vereinen, Kultur-, Bildungs- und Wissenschaftseinrichtungen.
Ein besonders enger Austausch verbindet die Stiftung Gedenkstätte Lindenstraße mit den drei bürgerschaftlichen Initiativen, die die Arbeit der Gedenkstätte unterstützen und begleiten: die Fördergemeinschaft »Lindenstraße 54«, die Häftlingsinitiative der Gedenkstätte Lindenstraße und der Verein zur Förderung der Projektwerkstatt »Lindenstraße 54« e. V.. Die drei Förderkreise leben vom Engagement ihrer Mitglieder und leisten durch ihre ehrenamtliche Arbeit einen wichtigen Beitrag zur erinnerungskulturellen Tätigkeit in der Gedenkstättenlandschaft der Region Berlin-Brandenburg.
Die Stiftung Gedenkstätte Lindenstraße wird gefördert von der Landeshauptstadt Potsdam und vom Ministerium für Wissenschaft, Forschung und Kultur des Landes Brandenburg.